More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0282 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  100 
 
 
326 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  79.51 
 
 
327 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  61.13 
 
 
316 aa  345  8e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  56.52 
 
 
335 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  52.77 
 
 
315 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  52.12 
 
 
315 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  54.9 
 
 
322 aa  292  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  52.44 
 
 
324 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  53.49 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  50 
 
 
349 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  52.63 
 
 
306 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  53.47 
 
 
314 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  50 
 
 
318 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  50.65 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  53.57 
 
 
314 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  49.84 
 
 
317 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  52.13 
 
 
318 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  49.52 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  51.77 
 
 
318 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  47.25 
 
 
305 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  47.4 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  45.36 
 
 
321 aa  215  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  44.86 
 
 
312 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  44.76 
 
 
309 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  44.89 
 
 
277 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  44.53 
 
 
277 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  44.53 
 
 
277 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  46.34 
 
 
315 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  47.06 
 
 
301 aa  202  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  46.34 
 
 
315 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  46.34 
 
 
315 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  42.76 
 
 
272 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  39.71 
 
 
280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  43.32 
 
 
314 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  43.07 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  38.46 
 
 
278 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.61 
 
 
358 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.31 
 
 
303 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.34 
 
 
276 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  38.13 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.59 
 
 
359 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.15 
 
 
359 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.23 
 
 
359 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.93 
 
 
372 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  36.56 
 
 
283 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  42.01 
 
 
311 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  41.58 
 
 
282 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.15 
 
 
368 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.64 
 
 
311 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37 
 
 
274 aa  168  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.86 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.96 
 
 
358 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  36.59 
 
 
279 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.32 
 
 
358 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  36.3 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  37.59 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40.73 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.88 
 
 
367 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.04 
 
 
360 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  35.93 
 
 
386 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  36.07 
 
 
286 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  33.92 
 
 
356 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.19 
 
 
413 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.13 
 
 
373 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  39.37 
 
 
706 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  40.93 
 
 
306 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.59 
 
 
360 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.59 
 
 
288 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  38.55 
 
 
279 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  36.59 
 
 
288 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  39.64 
 
 
362 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.77 
 
 
364 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  36.55 
 
 
311 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.73 
 
 
381 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.77 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36.13 
 
 
367 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.13 
 
 
364 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  36.13 
 
 
364 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.13 
 
 
364 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.13 
 
 
365 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.77 
 
 
364 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.79 
 
 
368 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  37.91 
 
 
393 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  32.62 
 
 
359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  38.27 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.77 
 
 
284 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.67 
 
 
365 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  34.67 
 
 
365 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.33 
 
 
359 aa  152  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  35.52 
 
 
281 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.77 
 
 
364 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.77 
 
 
364 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  34.18 
 
 
293 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.21 
 
 
274 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.91 
 
 
362 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.64 
 
 
371 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  34.91 
 
 
287 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  36.13 
 
 
402 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.31 
 
 
356 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  32.37 
 
 
359 aa  149  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>