More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0145 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  957    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  77.62 
 
 		 487 aa  750    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 493 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  39.46 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  37.14 
 
 		 485 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  35.24 
 
 		 495 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  36.73 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  32.79 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 		 484 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 509 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 492 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  35.21 
 
 		 509 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  32.47 
 
 		 467 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  32.65 
 
 		 497 aa  203  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  33.54 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  33.93 
 
 		 498 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 504 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 485 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  36.22 
 
 		 497 aa  190  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  39.19 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  30.93 
 
 		 488 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  31.43 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  31.64 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 527 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 510 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  31.74 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 516 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  29.44 
 
 		 481 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  31.55 
 
 		 507 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  25.79 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.84 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.38 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  22.9 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  22.71 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  22.66 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  22.66 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  22.66 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  22.66 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.41 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  22.25 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  28.76 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  24.42 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.4 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.34 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  27.27 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.02 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.96 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  21.41 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  22.7 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  20.85 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  33.33 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  22.83 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>