More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0094 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  38.1 
 
 
322 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  33.94 
 
 
327 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  34.34 
 
 
319 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  35.76 
 
 
324 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  35.76 
 
 
324 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  35.76 
 
 
324 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.71 
 
 
322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  36.13 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  35.08 
 
 
325 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  33.03 
 
 
324 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  33.22 
 
 
326 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  32.73 
 
 
335 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  36.14 
 
 
320 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  31.67 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  32.2 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  35.4 
 
 
321 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  30.7 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  33.22 
 
 
315 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  36.42 
 
 
322 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  32.53 
 
 
328 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  36.27 
 
 
328 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  33.85 
 
 
318 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  32.46 
 
 
318 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  38.46 
 
 
326 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  32.41 
 
 
327 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.54 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.91 
 
 
337 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  35.74 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  34.67 
 
 
321 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.71 
 
 
333 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  36.06 
 
 
328 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  34.66 
 
 
332 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33 
 
 
322 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  30.36 
 
 
319 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  34.86 
 
 
327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  35.61 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  35.61 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  32.53 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  30.89 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  31.38 
 
 
330 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  32.38 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.91 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  34.88 
 
 
330 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  30.54 
 
 
323 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  33.44 
 
 
318 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  31.29 
 
 
331 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  30.82 
 
 
330 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  31.27 
 
 
326 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  32.76 
 
 
331 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  33.44 
 
 
318 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  35.38 
 
 
340 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  33.44 
 
 
330 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  31.06 
 
 
316 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.79 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  29.29 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  31.47 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  31.21 
 
 
321 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  32.01 
 
 
316 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 
330 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  29.53 
 
 
324 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  33.45 
 
 
320 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  34.06 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  31.29 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  32.9 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  31.56 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  28.96 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.1 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  30.84 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  30.4 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  31.37 
 
 
316 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  31.06 
 
 
328 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  33.94 
 
 
335 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  30 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  32.71 
 
 
328 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0081  hypothetical protein  30.4 
 
 
326 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  32.23 
 
 
332 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  30.21 
 
 
321 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  31.99 
 
 
339 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  30.92 
 
 
325 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  34.93 
 
 
353 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  32.15 
 
 
321 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  30.64 
 
 
325 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.93 
 
 
328 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  33.66 
 
 
336 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  29.66 
 
 
351 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  29.06 
 
 
327 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  33.82 
 
 
335 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.91 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.42 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  34.06 
 
 
329 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  30.75 
 
 
325 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  33.89 
 
 
320 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  29.35 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  31.21 
 
 
330 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  33.46 
 
 
331 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.68 
 
 
322 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>