More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0087 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
355 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  78.1 
 
 
347 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  76.88 
 
 
346 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  76.3 
 
 
347 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  76.88 
 
 
346 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  74.93 
 
 
347 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  76.08 
 
 
345 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  76.37 
 
 
345 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  76.59 
 
 
346 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  50.72 
 
 
347 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  52.74 
 
 
345 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  48.85 
 
 
346 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  47.99 
 
 
346 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  48.28 
 
 
346 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  48.56 
 
 
345 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  45.69 
 
 
344 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  45.07 
 
 
363 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  43.93 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  44.09 
 
 
343 aa  319  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  43.93 
 
 
354 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  43.3 
 
 
358 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  29.46 
 
 
352 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.25 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.02 
 
 
363 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.1 
 
 
352 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.34 
 
 
374 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.39 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.45 
 
 
402 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
352 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.11 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.69 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.69 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.4 
 
 
362 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  34.52 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 
341 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.57 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.9 
 
 
365 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.23 
 
 
331 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33 
 
 
333 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  26.67 
 
 
334 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 
329 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.96 
 
 
380 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.05 
 
 
346 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  26.63 
 
 
377 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  25.85 
 
 
327 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.06 
 
 
341 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 
386 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  27.27 
 
 
345 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 
329 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  31.53 
 
 
383 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.69 
 
 
439 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  28.34 
 
 
436 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  28.34 
 
 
436 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  28.34 
 
 
436 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  28 
 
 
354 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  33.66 
 
 
333 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
379 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.27 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.84 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.61 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.76 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  28.34 
 
 
439 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  26.61 
 
 
348 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  29.13 
 
 
4483 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  26.9 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.45 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  26.99 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.15 
 
 
355 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  29.36 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  34.43 
 
 
354 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  26.44 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  28.9 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.22 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  23.12 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  30.36 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  27.22 
 
 
347 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  30.09 
 
 
387 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.93 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  26.8 
 
 
376 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.8 
 
 
377 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  25.57 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  25.57 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  27.57 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  26.67 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  26.61 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  34.27 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  22.35 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  36 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.44 
 
 
6889 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 
1107 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  25.72 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  24.65 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  27.32 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.22 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>