44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0067 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  86.21 
 
 
232 aa  430  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  81.47 
 
 
248 aa  410  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  76.6 
 
 
236 aa  384  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  66.81 
 
 
234 aa  333  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  64.47 
 
 
228 aa  321  8e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  52.81 
 
 
221 aa  218  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  44.16 
 
 
227 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  45.13 
 
 
233 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  43.11 
 
 
228 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  42.11 
 
 
217 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  40.79 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  42.36 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  39.74 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  38.6 
 
 
213 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  39.04 
 
 
213 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  38.16 
 
 
213 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  38.6 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  35.06 
 
 
216 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  38.43 
 
 
220 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  38.43 
 
 
220 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  38.43 
 
 
220 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  32.89 
 
 
214 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  26.25 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.23 
 
 
1265 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.77 
 
 
1503 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  27.75 
 
 
279 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.4 
 
 
1274 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.95 
 
 
1180 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2558  hypothetical protein  25.99 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000292512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.04 
 
 
1171 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.26 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  28.11 
 
 
314 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  23.58 
 
 
375 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0612  hypothetical protein  27.95 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000107431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0598  hypothetical protein  27.95 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  24.23 
 
 
308 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1276  hypothetical protein  28.1 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.415352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  20.22 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.04 
 
 
478 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  23.5 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>