55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0056 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  100 
 
 
427 aa  862    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  61.79 
 
 
424 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  58.63 
 
 
450 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  60 
 
 
442 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  56.45 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  60.3 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  54.73 
 
 
469 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  51.18 
 
 
435 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  52.35 
 
 
433 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  54.52 
 
 
587 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  46.17 
 
 
453 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  45.01 
 
 
446 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  45.41 
 
 
445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.81 
 
 
583 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.63 
 
 
533 aa  163  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  32.19 
 
 
535 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.55 
 
 
441 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.88 
 
 
589 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  28.11 
 
 
535 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.24 
 
 
532 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.41 
 
 
737 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.02 
 
 
548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  29.6 
 
 
407 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  27.8 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  30.67 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.95 
 
 
677 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  25.75 
 
 
604 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  29.06 
 
 
597 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.47 
 
 
612 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  29.8 
 
 
693 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  29.32 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  27.15 
 
 
658 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  27.96 
 
 
567 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  25.65 
 
 
535 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  24.65 
 
 
547 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  26.03 
 
 
408 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  25.85 
 
 
541 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  26.65 
 
 
631 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  26.89 
 
 
727 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  26.24 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  26.01 
 
 
411 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  26.65 
 
 
574 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  25 
 
 
636 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  27.59 
 
 
403 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  25.62 
 
 
399 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  24.94 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  25.12 
 
 
558 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  24.76 
 
 
850 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  25.59 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.5 
 
 
640 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.22 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.41 
 
 
824 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  22.35 
 
 
666 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  40.28 
 
 
469 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  21.58 
 
 
892 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>