More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0036 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0036  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  44.63 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  42.35 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0352  transcriptional regulator, LysR family  41.41 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0038  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  39.54 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6203  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5767  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2391  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0830106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5149  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.95 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  31.56 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  31.56 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  31.89 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  31.56 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  31.89 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2531  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2675  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3010  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  34.78 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 305 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  32.67 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.56 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  33.68 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.68 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.68 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  32.89 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  32.13 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0256  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  33 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>