72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0017 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  72.89 
 
 
266 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  44 
 
 
268 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  46.12 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  42.32 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  41.05 
 
 
257 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  40.17 
 
 
412 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  38.72 
 
 
368 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  42.19 
 
 
238 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  38.82 
 
 
242 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  37.87 
 
 
323 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  38.96 
 
 
234 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  39.47 
 
 
238 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  37.12 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  36.49 
 
 
218 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  36.09 
 
 
521 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  35.4 
 
 
229 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  35.22 
 
 
556 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  37.55 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.75 
 
 
243 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  30.36 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  31.07 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  33.61 
 
 
316 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  36.56 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  29.22 
 
 
262 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  28.51 
 
 
268 aa  99  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  28.97 
 
 
353 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  30.26 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  29.34 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  35 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  34.17 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.68 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.43 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.33 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  25.68 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  32.04 
 
 
205 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  29.83 
 
 
328 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.72 
 
 
197 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  26.75 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  31.45 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  28.89 
 
 
327 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  32.82 
 
 
200 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  31.45 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.14 
 
 
302 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  30 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  30 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  38.81 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  37.74 
 
 
204 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  34.75 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  34.48 
 
 
214 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  29.1 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  29.55 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.1 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  25.45 
 
 
251 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  30.91 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  27.48 
 
 
350 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.51 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  32.69 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  32.69 
 
 
229 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  32.69 
 
 
197 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  30 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  29.23 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  27.07 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  26.62 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  25.71 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  34.85 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  29.91 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  26.09 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  26.67 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  28.57 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  33.33 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  30.77 
 
 
232 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>