50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0005 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
185 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  85.87 
 
 
185 aa  312  2e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  62.6 
 
 
187 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  58.4 
 
 
217 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.57 
 
 
196 aa  139  2e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  55.2 
 
 
188 aa  133  1e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  55.56 
 
 
173 aa  131  4e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  53.45 
 
 
166 aa  129  2e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  52.14 
 
 
190 aa  127  9e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  52.14 
 
 
190 aa  127  9e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  52.14 
 
 
190 aa  127  9e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  42.95 
 
 
185 aa  125  4e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  55.08 
 
 
177 aa  125  4e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  43.56 
 
 
188 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  50.43 
 
 
187 aa  124  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  52.14 
 
 
273 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  51.28 
 
 
184 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  50.85 
 
 
180 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  54.7 
 
 
143 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  48.31 
 
 
196 aa  114  7e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  46.9 
 
 
171 aa  112  2e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  48.72 
 
 
206 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  47.86 
 
 
183 aa  108  4e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.24 
 
 
217 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  44.83 
 
 
164 aa  107  7e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  43.61 
 
 
207 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  41.13 
 
 
134 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  48.12 
 
 
198 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  51.28 
 
 
201 aa  101  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  41.35 
 
 
188 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  49.57 
 
 
171 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  39.05 
 
 
266 aa  99.4  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  45.28 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  45.19 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  38.3 
 
 
173 aa  76.6  2e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30.16 
 
 
155 aa  74.7  6e-13  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  32.85 
 
 
156 aa  73.9  1e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  38.3 
 
 
117 aa  69.7  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  25.26 
 
 
300 aa  54.3  1e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  27.71 
 
 
170 aa  49.3  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  34.78 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  26.67 
 
 
97 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  28.89 
 
 
102 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  32.14 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  32.08 
 
 
101 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  29.63 
 
 
101 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  30.14 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  23.33 
 
 
97 aa  41.6  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30.11 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>