More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2149 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  71.15 
 
 
108 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  70.19 
 
 
108 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  67.59 
 
 
108 aa  156  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  65.09 
 
 
106 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  66.36 
 
 
107 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  66.35 
 
 
108 aa  153  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  62.04 
 
 
108 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  64.42 
 
 
107 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  59.81 
 
 
107 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  61.11 
 
 
108 aa  148  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  62.04 
 
 
112 aa  146  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  67.65 
 
 
108 aa  146  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  66.34 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  63.46 
 
 
108 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  59.81 
 
 
107 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  60.95 
 
 
107 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  61.11 
 
 
108 aa  140  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  57.94 
 
 
107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  59.81 
 
 
109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  56.36 
 
 
113 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  62.5 
 
 
109 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  57.94 
 
 
107 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  55.56 
 
 
109 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  60.78 
 
 
116 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  60 
 
 
109 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  58.82 
 
 
115 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  61.05 
 
 
106 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  133  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  59 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  57.01 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  56.6 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  56.6 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  56.6 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  62.37 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  57.01 
 
 
107 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  57.01 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  62.89 
 
 
107 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  58.82 
 
 
125 aa  130  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  57.01 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  57.01 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  56.07 
 
 
124 aa  129  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  61.29 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  58.59 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  55.77 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  61.86 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  58.59 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  57.43 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  56.07 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  61.29 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  55.14 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  61.29 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  56.07 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  55.45 
 
 
146 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  60.22 
 
 
108 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  55.34 
 
 
106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  56.07 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  58.06 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  61.29 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  60.87 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  59.14 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  57.58 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  54.46 
 
 
146 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  52.83 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  59.38 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  61.29 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  55.14 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  55.14 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  55.14 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  56.57 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  59.14 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  59.14 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  54.21 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  59.38 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  56.12 
 
 
109 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  58.06 
 
 
106 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  56.99 
 
 
106 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  59.79 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  55.88 
 
 
110 aa  124  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  54.37 
 
 
109 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  52.34 
 
 
109 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  57.73 
 
 
107 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  58.06 
 
 
108 aa  123  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>