More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2049 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
435 aa  885  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  56.63 
 
 
424 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.38 
 
 
428 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  41.65 
 
 
434 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  40.44 
 
 
433 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  43.3 
 
 
441 aa  327  2e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  40.74 
 
 
431 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  2.38529e-08  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  42.38 
 
 
427 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  41.13 
 
 
429 aa  305  2e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  40.61 
 
 
495 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  41.78 
 
 
432 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  40.26 
 
 
427 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  38.72 
 
 
427 aa  273  5e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  35.94 
 
 
436 aa  272  8e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  33.71 
 
 
443 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 
431 aa  221  2e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
435 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  32.91 
 
 
434 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  32.32 
 
 
419 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  32.64 
 
 
434 aa  198  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
420 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 
422 aa  166  6e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 
435 aa  163  5e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 
451 aa  152  9e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
435 aa  136  6e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
441 aa  135  1e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
441 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.39 
 
 
438 aa  129  9e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 
424 aa  129  1e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.53 
 
 
435 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
424 aa  122  1e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
451 aa  120  4e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.53575e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
431 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.08 
 
 
434 aa  119  1e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 
428 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
442 aa  114  4e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
421 aa  114  4e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 
417 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
442 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 
441 aa  110  4e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
448 aa  110  7e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
441 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
419 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.38 
 
 
426 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 
444 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.99953e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
420 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
420 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.09 
 
 
436 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 
468 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
419 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  8.66815e-05 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
419 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
419 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.92 
 
 
437 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
412 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
412 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
417 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
417 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  28.19 
 
 
399 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
408 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  28.23 
 
 
413 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
412 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.23 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
439 aa  97.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  25.31 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
455 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
466 aa  85.9  1e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 
422 aa  86.3  1e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 
425 aa  83.6  7e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
434 aa  83.2  1e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
422 aa  81.6  2e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 
432 aa  81.6  3e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
493 aa  80.5  5e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
432 aa  80.5  5e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
455 aa  80.1  6e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
440 aa  78.2  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
435 aa  78.6  2e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
408 aa  79  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.95685e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.85 
 
 
380 aa  79  2e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
433 aa  79  2e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
452 aa  78.6  2e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
450 aa  77.8  3e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
431 aa  78.2  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
428 aa  77  6e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  27.45 
 
 
420 aa  77  7e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  27.45 
 
 
420 aa  76.6  7e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
428 aa  76.3  1e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.67 
 
 
428 aa  75.9  1e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
417 aa  76.3  1e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
458 aa  75.1  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
433 aa  75.1  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 
466 aa  75.1  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
441 aa  74.3  4e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
421 aa  73.9  5e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.26 
 
 
431 aa  73.9  5e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>