88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2041 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  258  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  61.07 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  59.84 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  59.85 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  62.12 
 
 		 135 aa  147  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  61.54 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  60 
 
 		 136 aa  146  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  56.82 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  60.61 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  56.92 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  60.31 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  60.77 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  53.85 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  59.69 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  58.59 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  56.59 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  57.04 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  60.31 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  56 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  56.03 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  53.03 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  59.35 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  52.34 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  40.94 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  31.01 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  43.84 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  42.03 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  43.1 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  41.54 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  34.44 
 
 		 262 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 262 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.87 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 279 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  34.44 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  43.08 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.67 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  40.54 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  34.67 
 
 		 452 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  34.38 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 266 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  36 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  37.31 
 
 		 69 aa  42  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  39.68 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  40.98 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  37.31 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  36 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  36 
 
 		 262 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  36 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 278 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 		 142 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 269 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  36 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  36 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  36 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  36 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  32.14 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  40.3 
 
 		 362 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.63 
 
 		 363 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  42.86 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  35.94 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  39.39 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  32.81 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  34.78 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  41.27 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  35.82 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  40 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 270 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  35.94 
 
 		 263 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  32.31 
 
 		 364 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>