157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2028 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  60.49 
 
 
205 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  58.54 
 
 
205 aa  254  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  59.02 
 
 
205 aa  253  2e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  56.86 
 
 
205 aa  241  8e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  56.8 
 
 
206 aa  233  1e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  56.94 
 
 
210 aa  228  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  56.16 
 
 
205 aa  227  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  52.91 
 
 
206 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  52.91 
 
 
206 aa  224  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  51.92 
 
 
208 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  51.92 
 
 
282 aa  224  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  51.94 
 
 
206 aa  221  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  55.71 
 
 
210 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  52.91 
 
 
206 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  51.22 
 
 
205 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  50.47 
 
 
209 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  38.5 
 
 
204 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  37.62 
 
 
208 aa  141  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  37.91 
 
 
209 aa  138  5e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  36.95 
 
 
205 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  35.15 
 
 
205 aa  134  7e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  36.45 
 
 
205 aa  134  1e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  35.96 
 
 
205 aa  134  1e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  133  2e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  32.67 
 
 
205 aa  131  7e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  33.5 
 
 
205 aa  129  2e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  37.5 
 
 
211 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  37.5 
 
 
211 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  37.5 
 
 
211 aa  120  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  34.15 
 
 
209 aa  119  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  38.24 
 
 
211 aa  119  4e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  35.1 
 
 
209 aa  119  4e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  35.1 
 
 
219 aa  117  1e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  33.65 
 
 
209 aa  117  2e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  31.6 
 
 
212 aa  114  9e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.12514e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  31.4 
 
 
209 aa  111  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  30.39 
 
 
209 aa  109  2e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  32.7 
 
 
209 aa  108  4e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  30.88 
 
 
209 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  36.54 
 
 
212 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  30.39 
 
 
207 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  32.52 
 
 
213 aa  104  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  31.22 
 
 
217 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  34.13 
 
 
214 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  30.73 
 
 
208 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  27.32 
 
 
206 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  29.95 
 
 
204 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  32.85 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  32.56 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  33.97 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  31.88 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  26.7 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  30.81 
 
 
215 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  29.08 
 
 
208 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  28.37 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  28.71 
 
 
214 aa  97.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  31.37 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  32.08 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  30.39 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  30.73 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  29.95 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  31.71 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  33.5 
 
 
213 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  32.35 
 
 
390 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  30.58 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  32.2 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  32.52 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  29.47 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  29.8 
 
 
204 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  94.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  32.69 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  29.59 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  30.19 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  30.19 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  28.83 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  30.39 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  26.21 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  29.59 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>