More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1997 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  527  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  50.2 
 
 
263 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  50.61 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  47.98 
 
 
268 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  46.37 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.19 
 
 
259 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  45.06 
 
 
296 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  44.84 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  47.58 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  44.4 
 
 
270 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  43.31 
 
 
275 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  44.4 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  44.18 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  45.6 
 
 
255 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  45.17 
 
 
255 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  44.35 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  45.79 
 
 
275 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  39.69 
 
 
276 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  39.36 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  39.36 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  41.6 
 
 
257 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  35.16 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  40 
 
 
289 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  40.39 
 
 
259 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.33 
 
 
271 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  34.43 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
302 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
301 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.14 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  32.95 
 
 
315 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  42.39 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
310 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
310 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  32.95 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  31.01 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 
303 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  31.01 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  32.68 
 
 
302 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
544 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  30.89 
 
 
308 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
307 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  30.23 
 
 
310 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
307 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
303 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
302 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  37.92 
 
 
267 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 
557 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 
301 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
305 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 
306 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
288 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  35.43 
 
 
294 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 
556 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  30.11 
 
 
562 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
568 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
568 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 
310 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
316 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
308 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 
313 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.92 
 
 
285 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  30.88 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  32.08 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
556 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  29.82 
 
 
550 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
278 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  33.47 
 
 
566 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  30.92 
 
 
566 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  31.68 
 
 
309 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
559 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  30.05 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  28.76 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.19 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  32.62 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  37.88 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>