More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1985 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
406 aa  767    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  38.87 
 
 
574 aa  173  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 
487 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  35.93 
 
 
485 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 
572 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  35.62 
 
 
581 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  36.64 
 
 
577 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  36.64 
 
 
577 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  36.64 
 
 
577 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  36.64 
 
 
577 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  34.93 
 
 
577 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  35.34 
 
 
577 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  36.18 
 
 
573 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  34.56 
 
 
597 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  38.51 
 
 
414 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.78 
 
 
598 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  32.75 
 
 
581 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  37.39 
 
 
598 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  30.46 
 
 
498 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  34.53 
 
 
580 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  34.14 
 
 
486 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  36.13 
 
 
509 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  33.66 
 
 
596 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  33.71 
 
 
626 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  36.89 
 
 
616 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  36.34 
 
 
597 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  35.95 
 
 
593 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  33.42 
 
 
597 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  35.78 
 
 
491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  36.78 
 
 
592 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  34.91 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 
608 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  34.62 
 
 
580 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  34.98 
 
 
505 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  35.57 
 
 
541 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  34.38 
 
 
576 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  33.68 
 
 
575 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  33.68 
 
 
575 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 
496 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  38.55 
 
 
569 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  34.19 
 
 
573 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  35.37 
 
 
578 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  35.37 
 
 
578 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  35.37 
 
 
578 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  35.37 
 
 
578 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  35.35 
 
 
578 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 
578 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  35.35 
 
 
578 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  35.35 
 
 
578 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  35.35 
 
 
578 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  35.1 
 
 
580 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  29.41 
 
 
478 aa  149  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  35.1 
 
 
580 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  36.74 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 
570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  34.34 
 
 
580 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  35.84 
 
 
580 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 
490 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  34.6 
 
 
580 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.31 
 
 
578 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  32.8 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  31.38 
 
 
481 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  36.75 
 
 
499 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  36.76 
 
 
597 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  36.49 
 
 
597 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  31.48 
 
 
506 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  35.96 
 
 
605 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  36.1 
 
 
610 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 
575 aa  143  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  36.09 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  36.84 
 
 
598 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  35.43 
 
 
498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  33.59 
 
 
576 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  33.59 
 
 
576 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  33.59 
 
 
576 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  33.59 
 
 
576 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  33.23 
 
 
485 aa  139  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  33.76 
 
 
574 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  34.6 
 
 
624 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  30.88 
 
 
445 aa  138  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  34.12 
 
 
582 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  34.02 
 
 
574 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  34.02 
 
 
574 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  33.41 
 
 
572 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  35.4 
 
 
588 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  33.67 
 
 
580 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  32.82 
 
 
574 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  33.15 
 
 
581 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  34.52 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  34.02 
 
 
624 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  34.96 
 
 
597 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  35.37 
 
 
501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  35.4 
 
 
498 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  34.68 
 
 
538 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  27.72 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  32.5 
 
 
590 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
527 aa  130  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 
530 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>