More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1841 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  62.98 
 
 
191 aa  231  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  64.29 
 
 
197 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  61.45 
 
 
201 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  60.1 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  61.22 
 
 
198 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  56.29 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  56.29 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  56.29 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  52.15 
 
 
216 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  52.63 
 
 
185 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  49.71 
 
 
180 aa  157  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  53.41 
 
 
187 aa  157  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  49.44 
 
 
181 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  49.41 
 
 
187 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  48.88 
 
 
181 aa  154  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  55.28 
 
 
187 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  48.85 
 
 
182 aa  148  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  48.34 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  45.57 
 
 
193 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  42.53 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  38.75 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  43.82 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  42.33 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  42.01 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  41.71 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  43.79 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  44.25 
 
 
440 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  43.79 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  43.67 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  45.98 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  38.51 
 
 
197 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  42.29 
 
 
195 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  42.29 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  42.48 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  42.29 
 
 
195 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  38.86 
 
 
196 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  41.4 
 
 
204 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  46.43 
 
 
207 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  42.21 
 
 
179 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  42.44 
 
 
193 aa  121  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  39.29 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  39.33 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  40.12 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  39.39 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  40.24 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  42.04 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  39.05 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  38.76 
 
 
180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  40.59 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  37.29 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  42.63 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  42.31 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  43.31 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  42.94 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  39.26 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  41.1 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  41.1 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  40.11 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  38.2 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  41.29 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  41.1 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  35.8 
 
 
194 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  41.1 
 
 
193 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  43.51 
 
 
203 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  38.36 
 
 
199 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  37.85 
 
 
201 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  38.54 
 
 
197 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  41.94 
 
 
200 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  35.23 
 
 
194 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  38.32 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  46.84 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  40.12 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  36.46 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  38.69 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  36.93 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  39.13 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  35.37 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  36.59 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  42.31 
 
 
196 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  35.03 
 
 
193 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  36.84 
 
 
206 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  40.38 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  43.37 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  39.62 
 
 
205 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  40.38 
 
 
195 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  45.51 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  41.83 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  40.38 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  39.26 
 
 
194 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  39.26 
 
 
194 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  40.26 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  34.22 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  43.79 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  32.48 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>