More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1620 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  100 
 
 		 179 aa  355  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  52.99 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  51.26 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  52.89 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  54.7 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  52.1 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  50.83 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  50.86 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  50.42 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  49.14 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  53.45 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  50 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  46.34 
 
 		 300 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  51.72 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  49.58 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  49.14 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  48.28 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  49.59 
 
 		 225 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  50.43 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  47.9 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  49.58 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  48.72 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  47.5 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  48.74 
 
 		 188 aa  117  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  46.9 
 
 		 163 aa  118  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  50 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  49.14 
 
 		 219 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  42.77 
 
 		 305 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  49.14 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  47.41 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  47.41 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  47.41 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  49.18 
 
 		 191 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  45.38 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  48.33 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  47.41 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  45.76 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  46.55 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  44.83 
 
 		 193 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  46.22 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  46.02 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  46.9 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  41.88 
 
 		 151 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  46.03 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  46.03 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  46.03 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  41.96 
 
 		 233 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  44.25 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  48.65 
 
 		 240 aa  98.6  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 230 aa  98.6  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  42.86 
 
 		 118 aa  97.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  40 
 
 		 148 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  42.97 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  42.11 
 
 		 162 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  41.8 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  38.71 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  37.7 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  33.59 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  40.5 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  40.17 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  36.09 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  40.5 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  38.28 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  34.32 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  32.77 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  39.58 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  40.62 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  42.71 
 
 		 143 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  39.8 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  39.18 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  41.58 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  39.8 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  38.54 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  39.8 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.54 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  30.52 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  38.54 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  36.15 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.54 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  34.51 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  36.97 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>