More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1565 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  75.89 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  71.43 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 113 aa  164  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 117 aa  156  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 113 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 113 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  62.04 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6203  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  61.61 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  57.14 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.26 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>