183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1562 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  100 
 
 
362 aa  702    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  53.72 
 
 
356 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  58.61 
 
 
359 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  51.83 
 
 
370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  54.42 
 
 
361 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  51.12 
 
 
366 aa  332  7.000000000000001e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  52.65 
 
 
354 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  49.58 
 
 
360 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  58.17 
 
 
365 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  55.25 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  56.79 
 
 
364 aa  326  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  51.69 
 
 
360 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  53.13 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  49.46 
 
 
368 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  49.46 
 
 
368 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  49.46 
 
 
368 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  53.85 
 
 
359 aa  315  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  50.97 
 
 
378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  50 
 
 
360 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  49.58 
 
 
373 aa  296  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  48.75 
 
 
362 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  47.75 
 
 
361 aa  288  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  46.67 
 
 
358 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  47.12 
 
 
362 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  44.85 
 
 
357 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  48.91 
 
 
359 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.24 
 
 
388 aa  262  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  46.82 
 
 
358 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  30.09 
 
 
396 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.4 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.49 
 
 
433 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  29.17 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.22 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.04 
 
 
440 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.07 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.88 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.25 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.42 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  28.13 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.53 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.64 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  22.97 
 
 
401 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.13 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  28.12 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.67 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  26.35 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.61 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  28.16 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  28.16 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  28.16 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  28.79 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  35.33 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.63 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  34.67 
 
 
445 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.29 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.38 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.55 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  27.59 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.66 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.66 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.66 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  27.25 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  26.3 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.23 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  27.25 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  26.57 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  27.65 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  29.35 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  33.33 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.64 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  29.07 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.44 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  28.01 
 
 
403 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  28.45 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.02 
 
 
407 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.93 
 
 
459 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  25.48 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.23 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  31.12 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  28.42 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.8 
 
 
433 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  28.95 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.93 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.93 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  25.21 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2992  amidohydrolase  29.07 
 
 
489 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.77 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  25.29 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.96 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.13 
 
 
437 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  28.99 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  29.92 
 
 
568 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  22.25 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  27.22 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.67 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.67 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.67 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.79 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  29.21 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.51 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>