251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1342 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
131 aa  249  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  45.68 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  44.87 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  41.74 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  37.07 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  41.33 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  36.7 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  41.89 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  29.91 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  41.56 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  42.03 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  24.69 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  33.79 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  39.19 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  37.04 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  36.05 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  34.17 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  35.9 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  34.29 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  32.11 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  40.54 
 
 
109 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  39.44 
 
 
113 aa  57  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  26.72 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  33.01 
 
 
118 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  30.43 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  40.85 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  36.49 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  37.35 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  30.65 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  30.23 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  35.44 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  40.28 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  38.03 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  34.55 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  36 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  32.43 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 
110 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  43.33 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  29.9 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  35.06 
 
 
112 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  29.07 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  34.94 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  31.65 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>