More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1330 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 876 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 876 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 874 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 875 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 879 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 874 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 867 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 875 aa  664    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 884 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 874 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 880 aa  662    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 898 aa  832    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 874 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 893 aa  977    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 931 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 876 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 874 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 874 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 874 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 904 aa  818    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 878 aa  713    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 889 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  61.98 
 
 		 889 aa  1037    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 880 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 874 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 886 aa  655    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 874 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 892 aa  933    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 874 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 876 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 863 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 886 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 882 aa  663    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 897 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 897 aa  803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 874 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 876 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 892 aa  989    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 864 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 903 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 886 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 899 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 874 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 863 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 881 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 874 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 877 aa  686    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 881 aa  943    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 883 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 876 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 878 aa  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 863 aa  653    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 872 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 874 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 876 aa  657    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 874 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 874 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 868 aa  638    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 905 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 874 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 884 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 876 aa  670    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 874 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 874 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 897 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 897 aa  804    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 865 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 886 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 879 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 879 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 874 aa  656    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 892 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 874 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 874 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 869 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 874 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 876 aa  673    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 874 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 874 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 874 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 876 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 886 aa  655    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 892 aa  877    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 897 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 892 aa  991    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 878 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 874 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 886 aa  1767    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 878 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 876 aa  673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  57.57 
 
 		 896 aa  944    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 874 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 897 aa  804    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 875 aa  661    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 898 aa  819    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 876 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 888 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 860 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 874 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>