33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1303 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  322  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 165 aa  252  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  75.62 
 
 		 164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  77.16 
 
 		 164 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  77.16 
 
 		 164 aa  251  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  75.31 
 
 		 164 aa  248  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  78.71 
 
 		 165 aa  248  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  79.35 
 
 		 165 aa  248  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  75.93 
 
 		 165 aa  248  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  74.52 
 
 		 162 aa  237  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  73.25 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  73.51 
 
 		 161 aa  227  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  69.28 
 
 		 183 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  66.46 
 
 		 184 aa  211  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  68.15 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  63.33 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  56 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 165 aa  166  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 171 aa  158  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 176 aa  150  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 179 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 194 aa  98.2  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  28.32 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  35.21 
 
 		 283 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  36 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 189 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 194 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  33.01 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>