More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1277 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
440 aa  835    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  57.82 
 
 
471 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.14 
 
 
465 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  53.85 
 
 
476 aa  375  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.41 
 
 
509 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  54.31 
 
 
515 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  53.93 
 
 
505 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  51.33 
 
 
484 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  52.2 
 
 
489 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  50.44 
 
 
452 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.5 
 
 
455 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.5 
 
 
455 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  53.5 
 
 
455 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  50 
 
 
493 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  51.54 
 
 
494 aa  336  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.7 
 
 
449 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  52.25 
 
 
457 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  55.6 
 
 
480 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  53.69 
 
 
460 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.3 
 
 
462 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  48.47 
 
 
517 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  50.22 
 
 
527 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.54 
 
 
502 aa  324  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  52.78 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.12 
 
 
539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.89 
 
 
472 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  53.03 
 
 
478 aa  319  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.28 
 
 
508 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  53.43 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  51.75 
 
 
486 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.57 
 
 
551 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.73 
 
 
495 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  50.84 
 
 
543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  50.32 
 
 
491 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  52.24 
 
 
460 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  38.19 
 
 
457 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.57 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.36 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.41 
 
 
452 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.29 
 
 
452 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  37.25 
 
 
446 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.55 
 
 
453 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.89 
 
 
455 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.41 
 
 
532 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  35.82 
 
 
444 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.85 
 
 
449 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.53 
 
 
443 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.7 
 
 
448 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  32.97 
 
 
448 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  35.89 
 
 
448 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.35 
 
 
456 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  36.3 
 
 
451 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  30.63 
 
 
447 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.04 
 
 
448 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  35.6 
 
 
451 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.68 
 
 
424 aa  187  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  30.97 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  29.8 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  31.21 
 
 
444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  30.75 
 
 
444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  30.97 
 
 
444 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  31.43 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.72 
 
 
444 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.92 
 
 
452 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  31.43 
 
 
444 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  31.43 
 
 
444 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.75 
 
 
444 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  31.43 
 
 
444 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  31.43 
 
 
444 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.28 
 
 
444 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.31 
 
 
443 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  37.36 
 
 
453 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.65 
 
 
449 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  36.54 
 
 
432 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  29.45 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.46 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.09 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.96 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  29.78 
 
 
427 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  38.36 
 
 
439 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  26.07 
 
 
435 aa  169  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.87 
 
 
427 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  38.39 
 
 
451 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.93 
 
 
442 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  26.71 
 
 
442 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.68 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  28.06 
 
 
440 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  28.89 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09910  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  31.9 
 
 
531 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000618646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  32.9 
 
 
429 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  33.25 
 
 
434 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  35.65 
 
 
419 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  32.9 
 
 
429 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.12 
 
 
429 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.68 
 
 
429 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  32.9 
 
 
429 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.69 
 
 
451 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  33.58 
 
 
473 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  35.25 
 
 
431 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.21 
 
 
419 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>