More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1275 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1275  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  100 
 
 
304 aa  608  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00827298  normal  0.435617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  55.12 
 
 
340 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  52.3 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.3 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.54 
 
 
443 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.71 
 
 
443 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.9 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.24 
 
 
310 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.51 
 
 
313 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.21 
 
 
441 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.78 
 
 
412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.59 
 
 
1131 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.42 
 
 
308 aa  228  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.010948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.21 
 
 
552 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  39.53 
 
 
1111 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  41.89 
 
 
278 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.56 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.97 
 
 
312 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.520966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1162  diguanylate cyclase  35.02 
 
 
373 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0804  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.54 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.504991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4451  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.19 
 
 
314 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1584  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.7 
 
 
319 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.335279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.78 
 
 
1023 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0543152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2062  GGDEF domain-containing protein  31.96 
 
 
306 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0349551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0013  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.38 
 
 
314 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.992585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0945  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.53 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0768  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.19 
 
 
353 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1937  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  42.13 
 
 
436 aa  152  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4115  response regulator receiver protein  31.1 
 
 
311 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.09 
 
 
883 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1989  diguanylate cyclase  41.11 
 
 
442 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000357818  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0282  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.56 
 
 
306 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2819  diguanylate cyclase  39.89 
 
 
438 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000520374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1313  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.57 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000261036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0280  response regulator receiver protein  32.78 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.932912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3193  diguanylate cyclase  39.89 
 
 
462 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0613  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 
1036 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0652  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.43 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.71 
 
 
786 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2291  GGDEF domain-containing protein  37.02 
 
 
442 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.11 
 
 
797 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.79 
 
 
606 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2051  diguanylate cyclase  39.66 
 
 
441 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.46 
 
 
773 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.11 
 
 
766 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.15 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  40.7 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.04 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0730  diguanylate cyclase  35.41 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0184  diguanylate cyclase  36.95 
 
 
446 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000988954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0201  diguanylate cyclase  35.32 
 
 
446 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  49.01 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.22 
 
 
753 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  40.12 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2369  diguanylate cyclase  38.12 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34805  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.23 
 
 
632 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 
238 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  48.34 
 
 
233 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.64 
 
 
337 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29300  Response regulator  33.57 
 
 
310 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.02 
 
 
349 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  47.68 
 
 
234 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
257 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.37 
 
 
246 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 
231 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2163  response regulator receiver protein  47.3 
 
 
231 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.49 
 
 
308 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2074  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
231 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 
245 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  37.64 
 
 
249 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 
246 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 
246 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5056  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.95 
 
 
228 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  36.87 
 
 
268 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.16 
 
 
322 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
229 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2486  diguanylate cyclase  37.78 
 
 
439 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000254421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.76 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  50 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.67 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  44.37 
 
 
235 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.2 
 
 
596 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 
235 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
237 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.39 
 
 
599 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  41.24 
 
 
223 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 
254 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 
234 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  46.97 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  44.6 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  38.42 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  44.6 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  45.03 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.42 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>