More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1259 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
312 aa  622  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  63.58 
 
 
323 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  61.41 
 
 
315 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  62.5 
 
 
311 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  59.93 
 
 
307 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  62.5 
 
 
322 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 
307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 
307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  61.74 
 
 
340 aa  360  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  59.93 
 
 
307 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 
307 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  60.98 
 
 
307 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  63.82 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 
307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  64.71 
 
 
317 aa  352  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 
310 aa  348  5e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  58.63 
 
 
308 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  60.07 
 
 
306 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  58.42 
 
 
312 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  56.01 
 
 
338 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  51.77 
 
 
321 aa  338  8e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 
309 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 
327 aa  334  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
310 aa  332  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 
330 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  57.47 
 
 
310 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  56.21 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  55.96 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  59.55 
 
 
314 aa  325  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  56.49 
 
 
310 aa  323  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 
314 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  322  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
305 aa  322  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 
312 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
313 aa  319  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  58.09 
 
 
319 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  53.53 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
303 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  52.75 
 
 
312 aa  317  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
318 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
315 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
298 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
303 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
318 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
301 aa  316  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
303 aa  315  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
303 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 
323 aa  311  5.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
303 aa  311  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 
309 aa  311  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 
311 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
333 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
335 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  52.1 
 
 
311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 
317 aa  309  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 
303 aa  309  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  53.53 
 
 
312 aa  308  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
307 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  56.03 
 
 
319 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
308 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
312 aa  305  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  54.25 
 
 
309 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  52.86 
 
 
317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  51.92 
 
 
313 aa  301  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 
306 aa  301  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
302 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
306 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 
308 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
303 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 
305 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
300 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
316 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 
316 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
305 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  47.96 
 
 
318 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
316 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 
316 aa  297  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
313 aa  296  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
320 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
316 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
316 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  47.3 
 
 
305 aa  295  5e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
311 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
312 aa  295  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
316 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  56.13 
 
 
312 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
316 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
306 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 
301 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
300 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>