159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1188 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  100 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  67.27 
 
 
283 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  65.59 
 
 
284 aa  354  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  63.93 
 
 
288 aa  342  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  61.82 
 
 
304 aa  338  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  63.47 
 
 
324 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  64.77 
 
 
285 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  64.21 
 
 
279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  65.66 
 
 
276 aa  335  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  59.78 
 
 
282 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  59.27 
 
 
274 aa  328  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  57.61 
 
 
280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  61.51 
 
 
302 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  59.27 
 
 
282 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  58.06 
 
 
279 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  60.37 
 
 
282 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  62.07 
 
 
288 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  58.18 
 
 
289 aa  314  9e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  61.72 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  60 
 
 
278 aa  310  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  62.4 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  59.25 
 
 
270 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  57.74 
 
 
292 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  61.3 
 
 
280 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  58.55 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  59.47 
 
 
272 aa  278  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  53.53 
 
 
304 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  53.53 
 
 
304 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  53.53 
 
 
304 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  55.38 
 
 
302 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  53.75 
 
 
282 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  52.61 
 
 
273 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  53.52 
 
 
303 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  52.36 
 
 
306 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  52.53 
 
 
291 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  55.82 
 
 
273 aa  257  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  32.87 
 
 
211 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.39 
 
 
219 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.39 
 
 
219 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.39 
 
 
219 aa  99  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  30.59 
 
 
217 aa  98.6  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.51 
 
 
219 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  33.03 
 
 
212 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 
207 aa  94.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  31.05 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  31.89 
 
 
210 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  28.31 
 
 
209 aa  85.9  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  29.57 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  34.04 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.63 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31.18 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  29.35 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  29.06 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  26.34 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  28.3 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  26.84 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  26.83 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  25.68 
 
 
210 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  29.06 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.15 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  26.84 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  25.37 
 
 
202 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.46 
 
 
217 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  25.85 
 
 
200 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  28.42 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.41 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.86 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  25.1 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  26.56 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  23.79 
 
 
199 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  26.37 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.24 
 
 
196 aa  56.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.86 
 
 
210 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  26.9 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  25.45 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  25.42 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.6 
 
 
232 aa  52.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  27.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  38.03 
 
 
181 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  24.44 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  23.75 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  23.46 
 
 
213 aa  48.9  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  25.29 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  27.84 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  28.14 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  26.32 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  26.88 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  29.12 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  24.61 
 
 
190 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  25.48 
 
 
203 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.82 
 
 
184 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  27.11 
 
 
187 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.37 
 
 
184 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  25.91 
 
 
272 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.11 
 
 
185 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  38.89 
 
 
180 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  38.89 
 
 
180 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>