More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1165 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  868    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  60.61 
 
 		 432 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  62.15 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  58.93 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  60.7 
 
 		 452 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  60.19 
 
 		 433 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  60.28 
 
 		 440 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  58.7 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  56.05 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  56.94 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  57.08 
 
 		 440 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  57.11 
 
 		 443 aa  481  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  56.8 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  57.51 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  57.21 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  57.18 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  57.54 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  58.89 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  55.76 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  56.81 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  57.24 
 
 		 442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  57.01 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  55.66 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  53.6 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  51.75 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  51.97 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  53 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  52.87 
 
 		 444 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  51.39 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  51.71 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  52.87 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  51.72 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  52.87 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  52.06 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  49.77 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  50.59 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  51.89 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  50.47 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  53.66 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  48.53 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  48 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  48.42 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.64 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  31.82 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  32.52 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.97 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  30.34 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.52 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  26.88 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  29.29 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  28.54 
 
 		 472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.89 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.88 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26.01 
 
 		 508 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  26.98 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.65 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.01 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  28.2 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.67 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.56 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  27.04 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.9 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  30.29 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.14 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.74 
 
 		 395 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  25.75 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  25.43 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  29.21 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  25.81 
 
 		 493 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.87 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  28.53 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  26.68 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.67 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  30.03 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.14 
 
 		 494 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  24.46 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  33.19 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  26.39 
 
 		 493 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  24.09 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  25.06 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  31.7 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  25.06 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.21 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.12 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  26.8 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  33.73 
 
 		 362 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.38 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.38 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  27.98 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  24.88 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  27.84 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.14 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  30.92 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.3 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  26.1 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>