179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1164 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 550 aa  1132    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  42.11 
 
 		 204 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  40.12 
 
 		 204 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 209 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  40.48 
 
 		 204 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  39.77 
 
 		 204 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  39.46 
 
 		 209 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  41.52 
 
 		 204 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  40.83 
 
 		 207 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  39.64 
 
 		 206 aa  101  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  40.48 
 
 		 209 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  38.01 
 
 		 205 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  38.41 
 
 		 205 aa  96.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  37.95 
 
 		 206 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  36.81 
 
 		 206 aa  95.1  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  39.51 
 
 		 206 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  37.8 
 
 		 205 aa  94  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 204 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  38.99 
 
 		 203 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  37.8 
 
 		 205 aa  92.8  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  37.27 
 
 		 204 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  32.99 
 
 		 217 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  37.82 
 
 		 204 aa  90.1  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  37.5 
 
 		 206 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  35.9 
 
 		 206 aa  89.4  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  38.36 
 
 		 203 aa  88.2  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  31.87 
 
 		 209 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  38.99 
 
 		 203 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  37.2 
 
 		 216 aa  85.9  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  30.93 
 
 		 211 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  34.32 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  32.94 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  37.74 
 
 		 204 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 210 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  37.74 
 
 		 204 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  31.32 
 
 		 211 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 210 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  35.85 
 
 		 204 aa  82.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  38.1 
 
 		 213 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  35.15 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  35.85 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  35.8 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  37.42 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  30.6 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  37.11 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  35.19 
 
 		 204 aa  79.7  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  30.6 
 
 		 211 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  31.95 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  36.25 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  32.78 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  34.62 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  35.37 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  33.74 
 
 		 205 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  31.32 
 
 		 207 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  34.18 
 
 		 205 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  34.88 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  29.41 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  26.99 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  29.41 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  36.71 
 
 		 209 aa  73.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  32.91 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  34.59 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  32.43 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  34.15 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  33.52 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  31.54 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  34.03 
 
 		 925 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  28.4 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 925 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  30.86 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  28.57 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.14 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  27.66 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  29.08 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  25.79 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  27.21 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  26.15 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  30.61 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  32.05 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  28.92 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  31.52 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  32.05 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  31.41 
 
 		 294 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  25.64 
 
 		 382 aa  57  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  25.68 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  26.36 
 
 		 392 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  23.94 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  29.94 
 
 		 583 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  25.64 
 
 		 388 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  27.07 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  27.07 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  27.13 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  31.52 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  25.68 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  25.56 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  23.57 
 
 		 377 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  25.52 
 
 		 405 aa  54.3  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  27.07 
 
 		 396 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2964  3'-5' exonuclease  30.46 
 
 		 308 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  31.5 
 
 		 385 aa  53.5  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>