More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1049 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  100 
 
 		 340 aa  650    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  55.52 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  48.84 
 
 		 328 aa  262  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  47.35 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2090  inner-membrane translocator  45.81 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.68 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.67 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  38.41 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  36.94 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.49 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.93 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.59 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  39.36 
 
 		 311 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.59 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.59 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  36.54 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.25 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.25 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  39.36 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  39.36 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.94 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.26 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  38.83 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  38.41 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  37.58 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.52 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.27 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  36.27 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  36.83 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  37.37 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  37.18 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  36.83 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  38.39 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  37.58 
 
 		 341 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  37.58 
 
 		 341 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  36.81 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.27 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  36.81 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.59 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.79 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  38 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  34.74 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  34.74 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  35.25 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.58 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  35.25 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  35.25 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  35.25 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  35.25 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.92 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 310 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  34.42 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  32.92 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  37.25 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.87 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  34.95 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  34.95 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  37.74 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.97 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  35.88 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>