132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0960 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  100 
 
 
449 aa  889    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.88 
 
 
821 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.06 
 
 
818 aa  269  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.18 
 
 
1919 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  41.3 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  40.69 
 
 
911 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  37.22 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.3 
 
 
1679 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 
547 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.34 
 
 
2082 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  42.96 
 
 
807 aa  209  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  40.83 
 
 
778 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.57 
 
 
837 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.7 
 
 
784 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  39.23 
 
 
792 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.76 
 
 
776 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  36.34 
 
 
717 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  39.16 
 
 
714 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  43.46 
 
 
376 aa  187  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  31.59 
 
 
743 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.12 
 
 
553 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  34.33 
 
 
477 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  36.61 
 
 
1129 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.61 
 
 
554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  36.87 
 
 
579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.25 
 
 
810 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.21 
 
 
469 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.79 
 
 
692 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.47 
 
 
567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  32.49 
 
 
575 aa  156  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  36.07 
 
 
560 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
745 aa  153  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  30.23 
 
 
363 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  30.33 
 
 
363 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.08 
 
 
555 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  33.25 
 
 
546 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.92 
 
 
556 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.86 
 
 
1848 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  33.5 
 
 
554 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  33.79 
 
 
593 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  35.69 
 
 
558 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.81 
 
 
561 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  34.58 
 
 
558 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  36.82 
 
 
835 aa  146  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  33 
 
 
417 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.99 
 
 
389 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  35.79 
 
 
551 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.14 
 
 
1147 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.34 
 
 
817 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  33.7 
 
 
553 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.05 
 
 
787 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  31.85 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.29 
 
 
706 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  34.76 
 
 
577 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  34.78 
 
 
569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.64 
 
 
1126 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  34.38 
 
 
602 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  30.3 
 
 
618 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  32.42 
 
 
1187 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  33.77 
 
 
403 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.84 
 
 
563 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.68 
 
 
570 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.93 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.13 
 
 
681 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.67 
 
 
941 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  31.81 
 
 
726 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  36.33 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  35.05 
 
 
638 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  31.72 
 
 
1207 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.44 
 
 
535 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  30.9 
 
 
443 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  33.12 
 
 
544 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.77 
 
 
737 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  47.33 
 
 
1222 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  27.81 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  25.21 
 
 
447 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  28.45 
 
 
454 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.26 
 
 
900 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  27.4 
 
 
332 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.28 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.59 
 
 
728 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  26.04 
 
 
624 aa  87.4  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  26.55 
 
 
597 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  23.71 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.58 
 
 
2816 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.37 
 
 
921 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  23.88 
 
 
547 aa  84  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  28.92 
 
 
371 aa  84  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  22.82 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  31.82 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  26.11 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.1 
 
 
326 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  27.27 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  32.61 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  23.88 
 
 
657 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.55 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  30.84 
 
 
2367 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3336  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein  28.84 
 
 
787 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0329371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  27.14 
 
 
14609 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.16 
 
 
643 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>