More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0938 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0938  shikimate kinase  100 
 
 		 172 aa  330  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.108411  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  36.59 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  43.29 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  37.35 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  39.13 
 
 		 171 aa  94  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  39.29 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  37.87 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  28.05 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  39.88 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  40 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  39.02 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  34.76 
 
 		 181 aa  89  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  32.93 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  36.2 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  36.2 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  36.2 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  36.2 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  37.41 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  35.62 
 
 		 195 aa  88.2  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12670  shikimate kinase  39.76 
 
 		 235 aa  87.8  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.799504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  39.86 
 
 		 182 aa  87.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  37.74 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  40.96 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  26.99 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  37.2 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  31.74 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  29.63 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  26.99 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  40.85 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  30.12 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  31.33 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 552 aa  85.5  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  36.81 
 
 		 191 aa  85.1  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  34.97 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0517  Shikimate kinase  29.81 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  35.58 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  35.58 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  37.27 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  34.78 
 
 		 229 aa  84.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  35.58 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 591 aa  84.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  35.93 
 
 		 458 aa  84  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 		 594 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  27.95 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  35.54 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  32.93 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  33.54 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  35.15 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  35.15 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  39.22 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  35.95 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  35.4 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  36.81 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  34.67 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  36.65 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  35.62 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6642  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.56 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0597755  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  38.96 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  36.36 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  34.94 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  38.36 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  32.3 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  34.97 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  35.95 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  27.61 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  34.34 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  34.57 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  27.33 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  38.41 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  34.97 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  33.95 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.95 
 
 		 317 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  32.93 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  33.73 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  38.46 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  34.34 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  35.37 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  34.34 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35 
 
 		 305 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>