More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0915 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  55.61 
 
 
256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  54.4 
 
 
200 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  53.76 
 
 
246 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  53.97 
 
 
239 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  43.54 
 
 
209 aa  141  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  45.18 
 
 
222 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  43.68 
 
 
223 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  39.77 
 
 
211 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  39 
 
 
203 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.04 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  34.76 
 
 
268 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  39.74 
 
 
363 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
237 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.49 
 
 
702 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  41.96 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  35.55 
 
 
218 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  37.37 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.41 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  26.18 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  33.78 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  28.37 
 
 
259 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  32.82 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  27.4 
 
 
256 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.21 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  39.33 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.66 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 
473 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  26.71 
 
 
204 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.9 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.65 
 
 
458 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  28.3 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  29.66 
 
 
229 aa  85.5  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  34.97 
 
 
224 aa  84.7  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 
235 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.92 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.71 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.6 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.19 
 
 
664 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.06 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.22 
 
 
457 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  28.44 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  24.34 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  31.14 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.94 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  27.04 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  38.04 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  37.65 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 
246 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  25.9 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.58 
 
 
521 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  27.08 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  34.22 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  27.08 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  27.08 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  27.53 
 
 
678 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  27.53 
 
 
678 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  32.4 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  32.24 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  33.12 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  31.08 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  26.96 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  35.48 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  27.1 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  26.4 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  30.26 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  37.1 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  29.7 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  37.1 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  32.97 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.06 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.87 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  33.71 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  36.56 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  40.25 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  37.68 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  26.44 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  27.38 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  37.68 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  37.68 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  37.68 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>