More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0908 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  100 
 
 		 338 aa  662    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  34.38 
 
 		 603 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.09 
 
 		 609 aa  133  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.36 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  30.57 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  30.62 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  29.47 
 
 		 616 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  28.98 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 454 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  33 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1974  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1287  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.7 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 435 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1504  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.28 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.41 
 
 		 620 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3553  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  29.03 
 
 		 604 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 297 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  29.84 
 
 		 593 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2015  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.60727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 454 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3425  inner-membrane translocator  30 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  27.69 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  29.1 
 
 		 593 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 562 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  29.24 
 
 		 606 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.41 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  27.35 
 
 		 358 aa  99.4  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  26.3 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2426  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.56 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  27.32 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  27.19 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  29.91 
 
 		 614 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>