122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0889 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  100 
 
 
390 aa  779    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  38.31 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  36.67 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.57 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.12 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  28.07 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  28.04 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0154  extracellular solute-binding protein, family 3  34.75 
 
 
323 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.68 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  30.06 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  34.48 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 
319 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  26.22 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.73 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.13 
 
 
322 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.24 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.1 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  24.92 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0362  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  26.49 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4109  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.18 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  31.82 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0145  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  33.12 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  25.94 
 
 
327 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  24.14 
 
 
329 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  29.36 
 
 
319 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  25.37 
 
 
346 aa  53.5  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.9 
 
 
339 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.63 
 
 
322 aa  53.5  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.63 
 
 
322 aa  53.5  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.16 
 
 
346 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  25.89 
 
 
325 aa  53.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.37 
 
 
336 aa  53.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  34.83 
 
 
794 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  23.1 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  32.43 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  26.73 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.08 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  28.21 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1606  NLPA lipoprotein  34.33 
 
 
297 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.712538  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  23.72 
 
 
357 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  31.82 
 
 
314 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
329 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0403  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  29.66 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  30.19 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  30.07 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  22.37 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.1 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  24.54 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.84 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.09 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.83 
 
 
309 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.59 
 
 
343 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.39 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4091  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.77 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00248715  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3528  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.58 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2245  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.58 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7163  taurine ABC transporter periplasmic binding protein  27.59 
 
 
336 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.62 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  28.25 
 
 
334 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.09 
 
 
343 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.43 
 
 
344 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5578  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.97 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  24.68 
 
 
380 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.11 
 
 
331 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2398  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.64 
 
 
326 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.593949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.89 
 
 
347 aa  46.2  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  22.3 
 
 
328 aa  46.2  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  25 
 
 
341 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1472  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.35 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  26.77 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3789  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  26.39 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  25.53 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0291  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  25.15 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  30.46 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  29.01 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2153  putative solute-binding periplasmic protein of ABC transport  30.89 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.35 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.77 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  22.96 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  23.15 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.95 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  32.81 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  23.83 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2923  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.96 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.13 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  28.48 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  27.35 
 
 
334 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.79 
 
 
335 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  32.2 
 
 
339 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6358  putative sulfonate ABC transporter, substrate-binding protein  25.76 
 
 
324 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.33 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.06 
 
 
338 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  22.33 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>