276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0776 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 
151 aa  283  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  83.54 
 
 
95 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  75.28 
 
 
90 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  73.91 
 
 
92 aa  130  7e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  72.41 
 
 
88 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  74.7 
 
 
86 aa  124  4e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  72.41 
 
 
88 aa  124  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 
86 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  79.07 
 
 
90 aa  118  2e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  68.6 
 
 
89 aa  114  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  70.11 
 
 
89 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  70.93 
 
 
86 aa  108  4e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  65 
 
 
86 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  63.22 
 
 
88 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 
86 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 
86 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  65.12 
 
 
88 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  63.95 
 
 
86 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  66.67 
 
 
107 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  69.62 
 
 
86 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  67.44 
 
 
86 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 
86 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  54.29 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  60.47 
 
 
86 aa  98.2  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  63.95 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  60.47 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  60.71 
 
 
88 aa  94  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  66.67 
 
 
86 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 
86 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 
86 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  64.37 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  53.51 
 
 
172 aa  87.8  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  65.82 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  65.12 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  55.56 
 
 
87 aa  82.8  2e-15  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 
87 aa  82.4  2e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 
87 aa  82.4  2e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  55.81 
 
 
95 aa  81.3  4e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  56.79 
 
 
89 aa  78.6  3e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  61.25 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  49.38 
 
 
105 aa  76.6  9e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 
86 aa  73.9  6e-13  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  51.95 
 
 
88 aa  70.9  5e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 
88 aa  69.7  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 
89 aa  68.2  4e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
96 aa  67.8  5e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  3.00859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  48.05 
 
 
88 aa  67.4  6e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  50 
 
 
89 aa  67  8e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  47.56 
 
 
88 aa  67  8e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
89 aa  66.6  1e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
90 aa  65.9  2e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.59944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 
94 aa  65.5  2e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.38 
 
 
88 aa  65.1  3e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.91631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  65.1  3e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  43.68 
 
 
84 aa  65.1  3e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.67926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  64.7  4e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  47.95 
 
 
87 aa  64.7  4e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.04078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  63.5  1e-09  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  48.72 
 
 
96 aa  63.5  1e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.67629e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 
112 aa  62.8  1e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  43.18 
 
 
99 aa  62.8  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  42.53 
 
 
88 aa  62.4  2e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  51.95 
 
 
90 aa  61.2  4e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.26326e-09  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  45.98 
 
 
92 aa  61.2  4e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  5.36683e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 
78 aa  60.5  8e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.16553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 
81 aa  60.5  8e-09  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 
97 aa  60.5  9e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 
98 aa  59.7  1e-08  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.84 
 
 
87 aa  59.7  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.8734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  45 
 
 
98 aa  59.7  1e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
88 aa  60.1  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45.12 
 
 
85 aa  60.1  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  60.1  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 
92 aa  58.5  3e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  45.83 
 
 
85 aa  58.5  3e-08  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
94 aa  58.2  4e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.34662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 
91 aa  58.2  4e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 
91 aa  58.2  4e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  46.48 
 
 
87 aa  58.2  4e-08  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  45.21 
 
 
87 aa  58.2  4e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 
77 aa  57.4  7e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 
97 aa  56.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 
97 aa  56.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  43.84 
 
 
87 aa  56.2  1e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.10534e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 
87 aa  56.6  1e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.77404e-11  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  41.98 
 
 
90 aa  56.2  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
85 aa  55.5  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
98 aa  55.8  2e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
85 aa  56.2  2e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 
91 aa  55.5  3e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.27 
 
 
115 aa  55.1  4e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  5.62255e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
85 aa  54.7  4e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>