More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0744 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  100 
 
 
332 aa  661    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  70.16 
 
 
310 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  70.82 
 
 
310 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  69.71 
 
 
311 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  67.65 
 
 
306 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  60.24 
 
 
326 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  61.54 
 
 
312 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  58.31 
 
 
339 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.84 
 
 
317 aa  388  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  60.74 
 
 
340 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  58.49 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  54.95 
 
 
317 aa  305  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  51.53 
 
 
293 aa  296  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  51.99 
 
 
312 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  48.04 
 
 
305 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  50.48 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
313 aa  282  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  47.57 
 
 
305 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  46.25 
 
 
323 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  47.35 
 
 
303 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  47.37 
 
 
327 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  45.78 
 
 
310 aa  272  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  48.18 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  47.3 
 
 
321 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  47.34 
 
 
320 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  47.08 
 
 
307 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  47.37 
 
 
303 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  46.38 
 
 
302 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  47.51 
 
 
312 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  46.23 
 
 
320 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  46.62 
 
 
311 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  48.71 
 
 
311 aa  255  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  49.02 
 
 
309 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  49.02 
 
 
309 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  47.51 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  47.04 
 
 
325 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  45.82 
 
 
307 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  43.37 
 
 
313 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  43 
 
 
314 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  45.93 
 
 
309 aa  248  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  46.46 
 
 
304 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  44.9 
 
 
373 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  45.74 
 
 
323 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  45.18 
 
 
345 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  45.9 
 
 
314 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  44.92 
 
 
301 aa  245  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.09 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  45.18 
 
 
342 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  44.97 
 
 
351 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  48.86 
 
 
310 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  44.97 
 
 
351 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  44.97 
 
 
304 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  44.97 
 
 
304 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  44.97 
 
 
304 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  44.97 
 
 
306 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  43.04 
 
 
320 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  44.97 
 
 
304 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  45.12 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  43.75 
 
 
304 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  44.77 
 
 
326 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  44.77 
 
 
304 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  43.75 
 
 
304 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  43.75 
 
 
304 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  47 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  44.05 
 
 
355 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  44.19 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 
324 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 
333 aa  229  7e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  45.12 
 
 
304 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  44.69 
 
 
315 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 
324 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  42.86 
 
 
304 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 
339 aa  225  8e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.61 
 
 
308 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
308 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.64 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.85 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 
305 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.14 
 
 
279 aa  219  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.03 
 
 
328 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.2 
 
 
328 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 
327 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.56 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.44 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.97 
 
 
310 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.84 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  37.34 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.72 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.35 
 
 
312 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.81 
 
 
345 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.65 
 
 
338 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
323 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  39.02 
 
 
305 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
338 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 
325 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.95 
 
 
309 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>