225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0592 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
264 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  55.91 
 
 
254 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 
254 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  53.17 
 
 
253 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 
249 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  54.47 
 
 
258 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  54.62 
 
 
251 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
256 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  52.4 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
254 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
252 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  51.61 
 
 
250 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 
249 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.79 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46 
 
 
254 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  52.21 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 
253 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 
253 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  53.75 
 
 
299 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 
253 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
255 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 
253 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.83 
 
 
253 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.83 
 
 
253 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
251 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 
255 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  44.68 
 
 
253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.62 
 
 
252 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  46.44 
 
 
255 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
257 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 
252 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 
254 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 
304 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
255 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 
255 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  47.95 
 
 
253 aa  225  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
254 aa  224  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 
255 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 
251 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  48.22 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.14 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  51.64 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 
254 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 
246 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 
250 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
254 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
251 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  48.37 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  45.71 
 
 
250 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  47.11 
 
 
251 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  46.05 
 
 
258 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  40.82 
 
 
255 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  48.76 
 
 
247 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
256 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
254 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
254 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
254 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
254 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  46.05 
 
 
258 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
262 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 
250 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 
250 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
254 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
247 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 
274 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
254 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
259 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  51.23 
 
 
260 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 
252 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 
257 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 
247 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
254 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 
247 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  44.92 
 
 
274 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  44.92 
 
 
274 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 
254 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  43.95 
 
 
270 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  45.87 
 
 
251 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 
254 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>