More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0551 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  75.11 
 
 		 269 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  72.27 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  71.91 
 
 		 246 aa  337  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  65.7 
 
 		 242 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  65.69 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  62.98 
 
 		 249 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  61.54 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  66.95 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  50.65 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  51.52 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 245 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  46.28 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  50.22 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 248 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.41 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  43.5 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  41.84 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.04 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  41.45 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 244 aa  165  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  44.13 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 244 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  40.33 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  43.61 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 225 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  44.21 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  39.56 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 240 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  38.6 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  40.09 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  36.12 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 185 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 277 aa  121  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 232 aa  122  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  35.07 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  41.42 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 238 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.93 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  36.12 
 
 		 245 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.33 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.8 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  40.44 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.63 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>