More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0421 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  100 
 
 
424 aa  854    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  49.38 
 
 
409 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  50 
 
 
407 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  44.29 
 
 
423 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  45.77 
 
 
408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  45.23 
 
 
424 aa  348  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  39.8 
 
 
399 aa  293  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  42.93 
 
 
411 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  37.5 
 
 
425 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.73 
 
 
415 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  40.21 
 
 
411 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  37.34 
 
 
429 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  41.32 
 
 
420 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  40.45 
 
 
400 aa  250  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  36.13 
 
 
427 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  37.41 
 
 
450 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  36.99 
 
 
436 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  54.3 
 
 
418 aa  243  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  51.06 
 
 
392 aa  242  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
439 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  48.13 
 
 
246 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  38.06 
 
 
456 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  38.14 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  36.6 
 
 
418 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  47.58 
 
 
468 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  36.95 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.47 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  52.97 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  45.81 
 
 
419 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  44.67 
 
 
250 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.47 
 
 
432 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  34.47 
 
 
415 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 
393 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 
393 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  37.02 
 
 
412 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  35.08 
 
 
711 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  37.82 
 
 
422 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
415 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  35.31 
 
 
472 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  34.67 
 
 
472 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
395 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  39.21 
 
 
413 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.84 
 
 
256 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
419 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  42.52 
 
 
439 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  49.58 
 
 
254 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45 
 
 
493 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  37.37 
 
 
443 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  42.55 
 
 
447 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  43.33 
 
 
244 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 
390 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
245 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  36.52 
 
 
435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  44.83 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40.22 
 
 
390 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  36.31 
 
 
428 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  37.29 
 
 
424 aa  226  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  48.51 
 
 
241 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  37.69 
 
 
438 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.28 
 
 
870 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  48.51 
 
 
241 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  36.29 
 
 
424 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  50.96 
 
 
411 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 
594 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  34.2 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  37.06 
 
 
428 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  45.98 
 
 
420 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.9 
 
 
247 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  33.61 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  45.26 
 
 
242 aa  222  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  41.44 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
433 aa  220  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  46.02 
 
 
816 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  40.07 
 
 
431 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  44.58 
 
 
266 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
262 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  44.44 
 
 
472 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  34.11 
 
 
405 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  45.61 
 
 
420 aa  219  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  48.26 
 
 
427 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
465 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  43.72 
 
 
422 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
465 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
465 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
469 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  39.72 
 
 
418 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
471 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
465 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  48.07 
 
 
418 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
465 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  32.39 
 
 
488 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
469 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.08 
 
 
421 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  41.15 
 
 
427 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  43.5 
 
 
605 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  50 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  34.67 
 
 
455 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.8 
 
 
397 aa  216  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
418 aa  216  5e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 
416 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>