123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0399 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  37.33 
 
 
181 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  40.14 
 
 
166 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 
181 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  33.12 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  33.12 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  32.9 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  36.08 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  39.46 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  34.44 
 
 
175 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  32.89 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  31.68 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  31.93 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  30.18 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  37.58 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 
182 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  37.72 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  32.14 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  34.51 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  40.74 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  31.76 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  31.41 
 
 
479 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  31.01 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  27.78 
 
 
291 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  30.12 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  28.4 
 
 
283 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  28.9 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  29.59 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  31.54 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 
255 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  31.72 
 
 
186 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  33.68 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  36.71 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  28.17 
 
 
232 aa  55.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  37.97 
 
 
179 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  31.21 
 
 
371 aa  55.1  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  33.02 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  30.81 
 
 
170 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  41.11 
 
 
512 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  30.57 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  34.62 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  41.27 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  30.99 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  29.05 
 
 
243 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  28.8 
 
 
541 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  28.39 
 
 
247 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  36.49 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  36.51 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 
195 aa  50.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  27.33 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  27.33 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  36.56 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  31.94 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  32.89 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  29.79 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  28 
 
 
282 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.7 
 
 
575 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  28.69 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  32.03 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  32.93 
 
 
522 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  23.21 
 
 
513 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  30.71 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  33.73 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  27.85 
 
 
504 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  32.1 
 
 
514 aa  47.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  25.61 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  32.95 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  26.96 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  32.61 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  30.86 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  31.94 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  31.11 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  29.23 
 
 
153 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.38 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  44.23 
 
 
126 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  30.26 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  30.26 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.09 
 
 
549 aa  44.7  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  28.68 
 
 
242 aa  44.3  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  39.13 
 
 
507 aa  44.3  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  34.38 
 
 
474 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  36.71 
 
 
492 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  32.26 
 
 
486 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  38.6 
 
 
550 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  32.26 
 
 
486 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  30.4 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  44 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>