More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0357 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  342  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  64.33 
 
 
153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  63.8 
 
 
160 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  66.23 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  67.32 
 
 
147 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  57.96 
 
 
170 aa  167  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.21 
 
 
196 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  57.58 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  68 
 
 
148 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  56.9 
 
 
184 aa  157  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  55.63 
 
 
165 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  55.48 
 
 
181 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.85 
 
 
170 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  53.22 
 
 
173 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  48.57 
 
 
211 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  45.7 
 
 
195 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  64.84 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.24 
 
 
157 aa  131  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  58.39 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  47.73 
 
 
207 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  51.97 
 
 
158 aa  124  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  54.67 
 
 
157 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  59.03 
 
 
157 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  58.59 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  61.49 
 
 
182 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  42.69 
 
 
190 aa  112  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  62.99 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  47.02 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  47.22 
 
 
188 aa  106  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  64.1 
 
 
146 aa  104  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  55.15 
 
 
148 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  42.95 
 
 
168 aa  92  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  42.98 
 
 
164 aa  89  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.59 
 
 
141 aa  87.8  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
160 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  37.4 
 
 
157 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  42.98 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.08 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.08 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  44.55 
 
 
141 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  57.35 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  44.88 
 
 
163 aa  85.5  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  35.63 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 
152 aa  84.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  31.65 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  31.65 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 
150 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  53.85 
 
 
155 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  53.85 
 
 
155 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  53.85 
 
 
155 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  33.79 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  39.37 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  35.9 
 
 
145 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  45.79 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  50.57 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  35.61 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  32.32 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  36.31 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  32.91 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  32.9 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  32.59 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  39.47 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  33.86 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  33.86 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  33.86 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  38.68 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.86 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.66 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  33.86 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  43.8 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  44.35 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.86 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  31.55 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  33.07 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  33.07 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  36.3 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  41.22 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  34.46 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  32.48 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  41.75 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  30 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  41.8 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  39.81 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.85 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  34.4 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  33.07 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  36.07 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  31.75 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.07 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  32.85 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  34.39 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>