More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0304 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  82.62 
 
 
397 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 
397 aa  691    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  84.89 
 
 
397 aa  682    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  86.65 
 
 
397 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  82.37 
 
 
396 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  78.59 
 
 
396 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  78.59 
 
 
396 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  84.89 
 
 
397 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  85.89 
 
 
397 aa  675    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.36 
 
 
397 aa  681    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  86.65 
 
 
397 aa  690    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  83.88 
 
 
397 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  80.86 
 
 
396 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  80.56 
 
 
396 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  87.15 
 
 
397 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  81.61 
 
 
396 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 
395 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  81.36 
 
 
396 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  81.61 
 
 
396 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  82.12 
 
 
397 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  80.86 
 
 
397 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  83.12 
 
 
397 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  81.61 
 
 
396 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  82.62 
 
 
397 aa  670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  85.89 
 
 
397 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  80.6 
 
 
395 aa  637    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  78.59 
 
 
396 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  80.81 
 
 
397 aa  682    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  100 
 
 
397 aa  807    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  82.37 
 
 
397 aa  690    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  81.61 
 
 
396 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  80.86 
 
 
396 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  82.87 
 
 
397 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  76.43 
 
 
401 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  76.69 
 
 
396 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  76.69 
 
 
396 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  75.06 
 
 
395 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  621  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  621  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  620  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  76.19 
 
 
396 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  75.69 
 
 
396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  75.69 
 
 
396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  75.5 
 
 
397 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  78.09 
 
 
396 aa  617  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  75.63 
 
 
397 aa  618  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.69 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.69 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  76.07 
 
 
396 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  614  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  615  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  615  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  75.69 
 
 
396 aa  616  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  76.07 
 
 
396 aa  615  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.49 
 
 
394 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.49 
 
 
394 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  76.07 
 
 
396 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  614  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.82 
 
 
400 aa  615  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.49 
 
 
394 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.49 
 
 
394 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  75.94 
 
 
391 aa  616  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  75.94 
 
 
391 aa  616  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  74.63 
 
 
400 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.5 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74.13 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.5 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.13 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  75.69 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  76.13 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  77.69 
 
 
396 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  607  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  74.12 
 
 
397 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  77.44 
 
 
396 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  77.44 
 
 
396 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  74.69 
 
 
396 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  74.12 
 
 
397 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  77.94 
 
 
396 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  607  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  77.69 
 
 
396 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.69 
 
 
396 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>