228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0286 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
163 aa  327  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  70.55 
 
 
163 aa  234  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  67.68 
 
 
164 aa  223  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  65.64 
 
 
162 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  64.81 
 
 
165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  66.87 
 
 
165 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  67.28 
 
 
165 aa  217  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  63.8 
 
 
163 aa  217  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  61.82 
 
 
164 aa  216  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  62.96 
 
 
163 aa  214  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  64.02 
 
 
167 aa  213  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  60.74 
 
 
163 aa  213  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  59.51 
 
 
163 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  60.74 
 
 
163 aa  208  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  61.35 
 
 
162 aa  205  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  59.75 
 
 
164 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  61.59 
 
 
163 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
179 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
179 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
179 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
163 aa  202  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  60.12 
 
 
163 aa  202  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
163 aa  201  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  62.5 
 
 
159 aa  200  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  58.49 
 
 
164 aa  198  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  57.58 
 
 
165 aa  197  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  59.51 
 
 
162 aa  197  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  56.44 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  58.9 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  55.83 
 
 
164 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 
162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  55.83 
 
 
163 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  58.02 
 
 
163 aa  184  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  58.64 
 
 
163 aa  183  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  57.23 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
161 aa  141  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  46.95 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  46.95 
 
 
161 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
161 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  46.91 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  46.95 
 
 
162 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  45.78 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 
161 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  50.3 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  45.73 
 
 
161 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  45.73 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 
162 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  43.37 
 
 
164 aa  124  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  47.56 
 
 
162 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  43.37 
 
 
164 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
163 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  46.95 
 
 
162 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
166 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  44.72 
 
 
163 aa  120  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  42.68 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  42.68 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  42.51 
 
 
165 aa  117  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  42.26 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  40.49 
 
 
161 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
161 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
161 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  44.17 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  43.56 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  41.92 
 
 
165 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  39.63 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  39.63 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
163 aa  111  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  39.16 
 
 
163 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  111  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  110  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  38.04 
 
 
161 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  38.18 
 
 
163 aa  110  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  39.63 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  39.63 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  39.63 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  37.42 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  41.67 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  39.63 
 
 
161 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  35.58 
 
 
160 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  40.24 
 
 
161 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  35.58 
 
 
160 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  39.02 
 
 
161 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>