More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0269 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  71.11 
 
 
250 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  65.95 
 
 
245 aa  255  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  65.95 
 
 
245 aa  254  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  64.14 
 
 
248 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  68.13 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  67.74 
 
 
253 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  67.58 
 
 
225 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  62.05 
 
 
240 aa  239  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  64.86 
 
 
236 aa  240  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  61.08 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  64.17 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  64.13 
 
 
252 aa  237  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.64 
 
 
227 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  64.67 
 
 
225 aa  235  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.54 
 
 
245 aa  235  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  64.48 
 
 
226 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  64.53 
 
 
246 aa  234  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  65.57 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  65.57 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  65.57 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  62.77 
 
 
239 aa  230  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  61.22 
 
 
283 aa  229  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  62.09 
 
 
275 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  61.08 
 
 
235 aa  225  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  60.1 
 
 
253 aa  225  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  65.05 
 
 
236 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  61.08 
 
 
213 aa  224  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  59.69 
 
 
229 aa  221  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.14 
 
 
236 aa  191  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.68 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.4 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  51.49 
 
 
171 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.54 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.55 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.33 
 
 
161 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42 
 
 
205 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.68 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.67 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.47 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  44.44 
 
 
202 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
202 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.07 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  44.12 
 
 
162 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  45.39 
 
 
202 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.24 
 
 
175 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  45.11 
 
 
200 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.24 
 
 
172 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.6 
 
 
197 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.91 
 
 
162 aa  104  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.35 
 
 
165 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  42.14 
 
 
199 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  45.11 
 
 
200 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.63 
 
 
213 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  44.68 
 
 
202 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  44.68 
 
 
202 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.03 
 
 
164 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  42 
 
 
206 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.63 
 
 
190 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  41.48 
 
 
168 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.84 
 
 
166 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.62 
 
 
179 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  38.85 
 
 
213 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  40 
 
 
166 aa  101  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.26 
 
 
182 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
199 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.8 
 
 
172 aa  101  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.88 
 
 
274 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  41.73 
 
 
175 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.09 
 
 
217 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.7 
 
 
163 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  42.07 
 
 
200 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  42.67 
 
 
206 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1495  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.42 
 
 
202 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  39.72 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  47.54 
 
 
592 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.49 
 
 
162 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.32 
 
 
166 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  39.24 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.35 
 
 
175 aa  99  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.41 
 
 
163 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  41.96 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  41.3 
 
 
201 aa  99  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.59 
 
 
787 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1494  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.72 
 
 
599 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>