More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0115 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  100 
 
 		 368 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  74.44 
 
 		 368 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  71.7 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  72.5 
 
 		 374 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  69.89 
 
 		 368 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  71.94 
 
 		 368 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  71.27 
 
 		 366 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  70.17 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  70.51 
 
 		 377 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  70.36 
 
 		 373 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  69.53 
 
 		 375 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  70.65 
 
 		 378 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  69.89 
 
 		 368 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  67.86 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  73.26 
 
 		 371 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  70.57 
 
 		 373 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  69.75 
 
 		 389 aa  484  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  70.91 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  72.22 
 
 		 369 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  70.64 
 
 		 376 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  71.99 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  70.64 
 
 		 376 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  70.67 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  69.89 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  62.98 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  52.73 
 
 		 351 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  39.95 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  36.1 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  36.49 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  39.34 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  34.49 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  41.05 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  36.7 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  36.96 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  38.04 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  35.44 
 
 		 364 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  35.77 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  33.97 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  33.78 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.45 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  33.68 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.89 
 
 		 378 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  30.11 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  33.87 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  34.43 
 
 		 375 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.15 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  31.9 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  31.9 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  34.74 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  32.69 
 
 		 371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  34.15 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  33.95 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.44 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.89 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.89 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.56 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  33.88 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  33.42 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.1 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  31.27 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.51 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  32.43 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  33.96 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  33.96 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  29.27 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  34.69 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  35.08 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.73 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  32.64 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.81 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  32.15 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  30.32 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  32.18 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.38 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  31.52 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  31.33 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  32.88 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  31.33 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.16 
 
 		 393 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.87 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.87 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  32.61 
 
 		 383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  30.89 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.38 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.58 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.99 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  30.14 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.75 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  29.44 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  30 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  32.27 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  31.37 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.69 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.89 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  32.7 
 
 		 381 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.72 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  32.62 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.03 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  33.51 
 
 		 397 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.95 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>