More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0114 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
377 aa  766    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  70.54 
 
 
373 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  73.78 
 
 
370 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  71.35 
 
 
370 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  69.73 
 
 
373 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  71.35 
 
 
369 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  68.82 
 
 
376 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  69.15 
 
 
374 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  66.05 
 
 
376 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  67.3 
 
 
376 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  65.58 
 
 
375 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  66.67 
 
 
370 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  67.55 
 
 
375 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  66.4 
 
 
374 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  63.56 
 
 
376 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  66.94 
 
 
417 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  64.5 
 
 
395 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  63.71 
 
 
376 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  62.6 
 
 
377 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  63.35 
 
 
381 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  63.14 
 
 
374 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  65.5 
 
 
375 aa  485  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  62.7 
 
 
371 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  62.97 
 
 
370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  62.97 
 
 
370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  62.97 
 
 
370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  66.05 
 
 
374 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  64.03 
 
 
372 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  63.51 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  60.38 
 
 
378 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  61.93 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  57.64 
 
 
387 aa  441  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  58.87 
 
 
372 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  58.93 
 
 
393 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  56.73 
 
 
380 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  61.25 
 
 
378 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  58.09 
 
 
379 aa  418  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  56.1 
 
 
382 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  46.47 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  31.43 
 
 
383 aa  170  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  29.75 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  28.33 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  27.73 
 
 
363 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  26.61 
 
 
361 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  28.79 
 
 
410 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  27.25 
 
 
352 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  28.42 
 
 
396 aa  99.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  28.05 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  27.79 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  27.18 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  26.63 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  25.35 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  27.06 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  25.53 
 
 
391 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  25.07 
 
 
358 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  26.45 
 
 
390 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  25.85 
 
 
390 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 
385 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  25.07 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  26.58 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  26.19 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  24.44 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  26.42 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 
390 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  25.46 
 
 
395 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  25.54 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  26.94 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  25.76 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
391 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6395  phosphoserine aminotransferase  26.48 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  25.67 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  26.02 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  27.44 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  27.46 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  27.1 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  26.3 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  24.09 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  24.74 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  25.96 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  26.7 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.69 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1104  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  24.6 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  23.45 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  24.66 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  24.85 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  24.46 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  25.68 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  25.48 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  23.16 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>