More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0109 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  259  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
143 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  52.59 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  52.27 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  52.41 
 
 
162 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  58.65 
 
 
153 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  56.39 
 
 
147 aa  123  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  51.09 
 
 
144 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  54.89 
 
 
158 aa  120  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  50.76 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  54.07 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  54.48 
 
 
151 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  52.27 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 
150 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  45.8 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
143 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
143 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
143 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
162 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  46.97 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
157 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  42.54 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 
152 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 
146 aa  90.5  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
151 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
150 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 
161 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  43.86 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  37.12 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  36.8 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  39.42 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  36.75 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  41.28 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  39.39 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
193 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>