298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0095 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  100 
 
 
270 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  54.07 
 
 
271 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  50.93 
 
 
270 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  54.62 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  49.62 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  48.51 
 
 
279 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  51.28 
 
 
274 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  49.43 
 
 
270 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  53.94 
 
 
291 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  47.21 
 
 
271 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  47.25 
 
 
274 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  48.34 
 
 
272 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  55.65 
 
 
292 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  46.72 
 
 
274 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  46.72 
 
 
274 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  46.72 
 
 
274 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  45.8 
 
 
273 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  47.3 
 
 
283 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  43.87 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  31.65 
 
 
370 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  29.97 
 
 
364 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  29.63 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  30.69 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  25.08 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  29.83 
 
 
675 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  35.59 
 
 
555 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.42 
 
 
452 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.51 
 
 
428 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  36.64 
 
 
369 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.21 
 
 
582 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  35.51 
 
 
434 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2834  beta-lactamase  28.26 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  27.34 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  24.44 
 
 
420 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.08 
 
 
446 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  31.25 
 
 
784 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1900  beta-lactamase  30.14 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.54 
 
 
377 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  25.45 
 
 
566 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  28.26 
 
 
790 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  35.11 
 
 
478 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.08 
 
 
381 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  34.97 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  34.29 
 
 
463 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  25 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  35 
 
 
441 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.1 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.08 
 
 
390 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  32.23 
 
 
1037 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  32.62 
 
 
374 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  30.88 
 
 
502 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  27.24 
 
 
449 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.3 
 
 
406 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.22 
 
 
337 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  27.17 
 
 
792 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  28.46 
 
 
395 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  27.27 
 
 
785 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  34.9 
 
 
417 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  32.64 
 
 
370 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  22.71 
 
 
379 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  33.1 
 
 
796 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  33.1 
 
 
796 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.65 
 
 
497 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.34 
 
 
453 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  25.7 
 
 
966 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  23.14 
 
 
419 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  35.14 
 
 
560 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  26.69 
 
 
416 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  25.09 
 
 
717 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  34.43 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.29 
 
 
461 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  30.5 
 
 
378 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  30.87 
 
 
405 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  23.17 
 
 
395 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  33.09 
 
 
450 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3827  beta-lactamase  30.8 
 
 
326 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809801  normal  0.0296333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.68 
 
 
370 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  28.79 
 
 
408 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  33.85 
 
 
459 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  34.13 
 
 
451 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  33.33 
 
 
351 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28 
 
 
446 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  26.95 
 
 
348 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.19 
 
 
450 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  21.53 
 
 
381 aa  52.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  22.76 
 
 
353 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  32.81 
 
 
374 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.85 
 
 
501 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.95 
 
 
464 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  25.7 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  28.48 
 
 
494 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  24.33 
 
 
430 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.29 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4495  Beta-lactamase  25.48 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.13 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3184  beta-lactamase  31.37 
 
 
389 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  33.08 
 
 
499 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2001  beta-lactamase  30 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  29.73 
 
 
396 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  28.1 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>