35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0084 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0084  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  839  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4891  hypothetical protein  65.92 
 
 
446 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0782  hypothetical protein  61.56 
 
 
415 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540249  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2685  hypothetical protein  57.66 
 
 
418 aa  459  1e-128  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  0.62203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31730  hypothetical protein  56.72 
 
 
413 aa  452  1e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.872295  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0673  hypothetical protein  57.21 
 
 
428 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.527645  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7709  hypothetical protein  57.46 
 
 
403 aa  447  1e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0915  hypothetical protein  55.42 
 
 
420 aa  440  1e-122  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0866  hypothetical protein  55.5 
 
 
472 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0244  hypothetical protein  58.15 
 
 
421 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0527558  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0285  hypothetical protein  58.15 
 
 
421 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0749  hypothetical protein  54.28 
 
 
471 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2066  hypothetical protein  55.03 
 
 
413 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465784  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12720  hypothetical protein  56.14 
 
 
413 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.520291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2951  hypothetical protein  56.03 
 
 
413 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1472  lipopolysaccharide kinase  54.52 
 
 
470 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03780  hypothetical protein  52.56 
 
 
423 aa  405  1e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0069  hypothetical protein  52.61 
 
 
471 aa  408  1e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0105826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4011  hypothetical protein  51.63 
 
 
401 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04000  hypothetical protein  52.6 
 
 
433 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  50.85 
 
 
411 aa  364  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  50 
 
 
415 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1789  hypothetical protein  43.31 
 
 
410 aa  283  5e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  43.19 
 
 
410 aa  282  6e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2160  hypothetical protein  43.31 
 
 
409 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1247  hypothetical protein  40.89 
 
 
422 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1264  hypothetical protein  40.89 
 
 
422 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1274  hypothetical protein  40.89 
 
 
422 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294638  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1640  hypothetical protein  39.65 
 
 
422 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.229414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5157  hypothetical protein  37.15 
 
 
412 aa  240  3e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3855  hypothetical protein  39.16 
 
 
419 aa  240  3e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0416  hypothetical protein  40.16 
 
 
402 aa  233  4e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875248  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2540  hypothetical protein  37.65 
 
 
420 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  26.42 
 
 
262 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  32.33 
 
 
249 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>