More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0083 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  100 
 
 
250 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  53.66 
 
 
363 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  54.39 
 
 
386 aa  231  7e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  50.4 
 
 
314 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  51.45 
 
 
372 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.01 
 
 
321 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  52.42 
 
 
324 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  49.19 
 
 
314 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  48.96 
 
 
314 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49 
 
 
320 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  49.79 
 
 
373 aa  218  9e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.79 
 
 
327 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.45 
 
 
326 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  52.97 
 
 
312 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.21 
 
 
306 aa  215  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.19 
 
 
316 aa  212  4e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  49.37 
 
 
320 aa  212  5e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.04 
 
 
321 aa  211  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.63 
 
 
326 aa  211  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  45.21 
 
 
330 aa  211  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13612  tRNA/rRNA methyltransferase  48.32 
 
 
322 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.288349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  47.11 
 
 
323 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.58 
 
 
331 aa  208  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.76 
 
 
322 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  47.6 
 
 
322 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03800  rRNA methylase, putative, group 3  44.88 
 
 
329 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.395862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.91 
 
 
329 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  42.91 
 
 
328 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.2 
 
 
333 aa  201  1e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31740  rRNA methylase, putative, group 3  48.13 
 
 
339 aa  200  2e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.29916  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.61 
 
 
324 aa  198  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8152  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.37 
 
 
339 aa  197  1e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4822  RNA methyltransferase  48.98 
 
 
314 aa  196  4e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945978  normal  0.837173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4736  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.98 
 
 
314 aa  196  4e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5122  RNA methyltransferase  48.98 
 
 
314 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.44 
 
 
324 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0655  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.21 
 
 
319 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.229838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.78 
 
 
245 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.07271e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.46 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.58465e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.27809e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  38.46 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.46 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  45.78 
 
 
246 aa  175  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.46 
 
 
247 aa  174  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.53 
 
 
256 aa  174  1e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.06 
 
 
247 aa  174  1e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.96945e-07  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.64 
 
 
246 aa  173  2e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.23613e-09  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.24 
 
 
246 aa  173  2e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0353  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  49.35 
 
 
339 aa  173  2e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  46.86 
 
 
245 aa  173  3e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.72 
 
 
256 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  36.84 
 
 
247 aa  172  6e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.84808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.94 
 
 
249 aa  171  8e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22091e-06 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.8 
 
 
239 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  37.66 
 
 
248 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  37.66 
 
 
248 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.02 
 
 
247 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.4032e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.72 
 
 
256 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  41.9 
 
 
251 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.84 
 
 
310 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.81 
 
 
246 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
247 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.64025e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.93 
 
 
250 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.53 
 
 
248 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.99 
 
 
327 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.43 
 
 
315 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.34493e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  38.82 
 
 
277 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  38.11 
 
 
244 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.14375e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  41.77 
 
 
245 aa  164  1e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  39.02 
 
 
243 aa  164  1e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.88208e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.44 
 
 
261 aa  164  1e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  41.74 
 
 
270 aa  164  2e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
249 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.49 
 
 
246 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.64 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  43 
 
 
270 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  35.37 
 
 
289 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.31 
 
 
248 aa  162  4e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  36.18 
 
 
323 aa  162  4e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  43.27 
 
 
242 aa  162  4e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.68 
 
 
246 aa  162  5e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  34.96 
 
 
289 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  38.4 
 
 
248 aa  161  8e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.22 
 
 
336 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 
253 aa  161  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.29806e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.44 
 
 
240 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  45.15 
 
 
243 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  5.46108e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.51 
 
 
250 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  38.21 
 
 
249 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.6 
 
 
250 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.94989e-05  hitchhiker  8.41642e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  46.03 
 
 
248 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  43.72 
 
 
244 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.58 
 
 
416 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.58 
 
 
442 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.8 
 
 
251 aa  158  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.33 
 
 
334 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>